AFM-Teststrukturen: DNA-Origami Rechtecke

GQ-AFM

Mit der AFM Teststruktur von GATTAquant steht ab sofort eine biokompatible Kalibrierprobe für die AFM Technologie zur Verfügung. Die Probe stellt eine sehr definierte Struktur aus DNA dar und ist somit perfekt geeignet, um die Auflösung von Rasterkraftmikroskopen an biologischen Proben zu optimieren und zu messen.

Produktdetails

Beschreibung

Testprozeduren zur Ermittlung der erreichbaren räumlichen Auflösung von Rasterkraftmikroskopen sind wichtig, um die Möglichkeiten aber auch die Limitierungen beim Abbilden unter realistischen Bedingungen zu untersuchen. Mit der AFM Teststruktur von GATTAquant steht eine biokompatible Kalibrierprobe für die AFM Technologie zur Verfügung. Die aus DNA hergestellte Probe bildet ein Rechteck mit den Kantenlängen 70 nm mal 100 nm und einer Höhe von 2 nm. Die leiterförmige Substruktur in der Mitte der GATTA-AFM-Probe weist einen Sprossenabstand von 6 nm auf. Die Probe stellt eine sehr definierte Struktur aus DNA dar und ist somit perfekt geeignet, um die Auflösung von Rasterkraftmikroskopen an biologischen Proben zu optimieren und zu messen.

Die Proben werden in Lösung verschickt. Die Stoffmenge ist ausreichend für mindestens 10 AFM Oberflächen auf Mica-Plättchen, dichtgepackt mit den DNA-Origami Rechtecken.

Abmessungen der Teststrukturen	~ 90 nm x 70 nm x 2 nm
Leiterförmige Substruktur in der Mitte	6 ± 1 nm
Empfohlen für	Intermittierender Modus in wässriger Umgebung
Volumen	> ≥120 µl
Konzentration	> ≥5 nM

Immobilisierung von GATTA-AFM-Nanorulern

Immobilisierungsstrategie unter Verwendung von Glimmerplättchen und Mikroskopieren unter flüssigen Bedingungen

l) Verwenden Sie eine frisch abgezogene Glimmeroberfläche (z. B. eine 12mm Glimmerscheibe, die auf einen Metallpuck geklebt ist) und inkubieren Sie sie 1 Minute lang mit 20 μl Faltpuffer (1x FB: 1x TAE, ergänzt mit 10 mM MgCl2). Die Glimmerplatte muss sauber und flach sein, ohne Defekte oder Risse. Geben Sie den Puffer homogen auf die gesamte Glimmeroberfläche.
ll) Fügen Sie dem Puffer auf dem Glimmer etwa 10-50 fmol GATTA-AFM-Probe hinzu (dies entspricht beispielsweise 1-5 μl Volumen bei einer Probenkonzentration von 10 nM). Kippen Sie die Glimmerplatte vorsichtig in alle Richtungen, um die Probe über die gesamte Oberfläche zu verteilen und lassen Sie sie weitere 2 Minuten inkubieren.
lll) Ihre GATTA-AFM-Probe ist gebrauchsfertig. Bei Bedarf kann mehr Puffer (1x FB) hinzugefügt werden. Magnesiumionen können durch andere stark zweiwertige Ionen ersetzt werden (einwertige Ionen wie Natrium sollten vermieden werden). Bitte beachten Sie, dass das Ändern der Ionen möglicherweise besondere Sicherheitsmaßnahmen erfordert und die Form und Stabilität der DNA-Nanostruktur beeinflussen kann.

Mikroskopieren unter trockenen Bedingungen
lV) Bereiten Sie zwei Uhrengläser oder flache Schalen vor, eine mit 70/30% Ethanol / Wasser, die andere mit reinem Ethanol.
V) Bereiten Sie Ihre Probe gemäß den Schritten i) -iii) vor.
Vl) Nehmen Sie eine Pinzette und tauchen Sie Ihr Glimmerblättchen aus Schritt iii) kurz in das Ethanol / Wasser-Bad. Direkt danach in das Ethanolbad überführen und dort einige Sekunden eintauchen.
Vll) Nehmen Sie das Glimmerblättchen aus dem Ethanolbad und lassen Sie es trocknen ( trocknen an Luft oder unter leichtem N2-Strom). Wenn das Glimmerscheibchen trocken ist, ist es gebrauchsfertig.

Andere Abmessungen und Formen für Glimmer können ebenfalls verwendet werden. Bitte passen Sie die verwendeten Mengen entsprechend an.